Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cabp4Q8VHC5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cabp4Q8VHC5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms