Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shtn1Q8K2Q9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms