Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 247.6 ms