Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lancl3Q8CD19 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lancl3Q8CD19 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms