Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms