Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fndc3c1Q6DFV6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc3c1Q6DFV6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms