Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU8

Bpifa6, BPI fold-containing family A, member 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa6Q0VGU8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bpifa6Q0VGU8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms