Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frat1P70339 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frat1P70339 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frat1P70339 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frat1P70339 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frat1P70339 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frat1P70339 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Frat1P70339 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frat1P70339 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frat1P70339 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frat1P70339 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frat1P70339 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frat1P70339 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frat1P70339 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frat1P70339 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frat1P70339 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frat1P70339 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frat1P70339 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frat1P70339 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frat1P70339 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frat1P70339 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frat1P70339 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frat1P70339 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frat1P70339 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frat1P70339 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frat1P70339 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frat1P70339 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frat1P70339 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frat1P70339 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms