Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfixP70257 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfixP70257 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfixP70257 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfixP70257 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfixP70257 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfixP70257 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfixP70257 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfixP70257 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfixP70257 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfixP70257 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NfixP70257 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NfixP70257 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NfixP70257 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NfixP70257 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NfixP70257 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NfixP70257 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NfixP70257 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfixP70257 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfixP70257 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfixP70257 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfixP70257 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfixP70257 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfixP70257 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfixP70257 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfixP70257 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfixP70257 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfixP70257 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfixP70257 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfixP70257 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfixP70257 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfixP70257 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NfixP70257 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfixP70257 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfixP70257 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfixP70257 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfixP70257 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfixP70257 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfixP70257 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfixP70257 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfixP70257 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfixP70257 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfixP70257 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfixP70257 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfixP70257 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfixP70257 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NfixP70257 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfixP70257 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfixP70257 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfixP70257 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfixP70257 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfixP70257 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfixP70257 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfixP70257 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfixP70257 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfixP70257 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfixP70257 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfixP70257 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfixP70257 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfixP70257 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfixP70257 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfixP70257 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfixP70257 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfixP70257 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfixP70257 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfixP70257 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfixP70257 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfixP70257 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfixP70257 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NfixP70257 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NfixP70257 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NfixP70257 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NfixP70257 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NfixP70257 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NfixP70257 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfixP70257 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfixP70257 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfixP70257 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfixP70257 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfixP70257 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfixP70257 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfixP70257 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfixP70257 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfixP70257 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfixP70257 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NfixP70257 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NfixP70257 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfixP70257 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfixP70257 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfixP70257 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfixP70257 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfixP70257 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfixP70257 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfixP70257 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfixP70257 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfixP70257 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfixP70257 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfixP70257 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfixP70257 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfixP70257 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms