Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CartptP56388 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CartptP56388 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CartptP56388 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CartptP56388 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CartptP56388 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CartptP56388 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CartptP56388 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CartptP56388 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CartptP56388 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CartptP56388 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CartptP56388 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CartptP56388 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CartptP56388 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CartptP56388 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CartptP56388 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CartptP56388 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CartptP56388 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CartptP56388 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CartptP56388 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CartptP56388 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CartptP56388 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CartptP56388 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CartptP56388 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CartptP56388 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CartptP56388 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CartptP56388 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CartptP56388 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CartptP56388 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CartptP56388 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CartptP56388 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CartptP56388 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CartptP56388 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CartptP56388 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CartptP56388 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CartptP56388 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CartptP56388 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CartptP56388 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CartptP56388 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CartptP56388 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CartptP56388 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CartptP56388 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CartptP56388 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CartptP56388 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CartptP56388 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CartptP56388 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CartptP56388 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CartptP56388 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CartptP56388 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CartptP56388 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CartptP56388 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CartptP56388 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CartptP56388 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CartptP56388 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CartptP56388 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CartptP56388 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CartptP56388 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CartptP56388 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CartptP56388 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CartptP56388 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CartptP56388 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CartptP56388 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CartptP56388 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CartptP56388 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CartptP56388 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CartptP56388 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CartptP56388 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CartptP56388 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
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CartptP56388 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CartptP56388 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CartptP56388 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CartptP56388 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CartptP56388 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CartptP56388 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CartptP56388 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CartptP56388 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CartptP56388 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CartptP56388 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CartptP56388 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CartptP56388 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CartptP56388 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CartptP56388 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CartptP56388 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CartptP56388 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CartptP56388 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CartptP56388 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CartptP56388 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CartptP56388 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CartptP56388 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CartptP56388 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CartptP56388 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CartptP56388 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CartptP56388 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CartptP56388 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CartptP56388 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CartptP56388 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CartptP56388 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CartptP56388 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CartptP56388 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms