Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa11P50709 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa11P50709 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa11P50709 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa11P50709 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa11P50709 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa11P50709 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa11P50709 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa11P50709 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa11P50709 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa11P50709 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa11P50709 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa11P50709 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa11P50709 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms