Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc10P31257 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc10P31257 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms