Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cnga1P29974 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cnga1P29974 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms