Protein–RNA interactions for Protein: P25916

Bmi1, Polycomb complex protein BMI-1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmi1P25916 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms