Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prf1P10820 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prf1P10820 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prf1P10820 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prf1P10820 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prf1P10820 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prf1P10820 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prf1P10820 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms