Protein–RNA interactions for Protein: P06325

Tcrg-V1, T-cell receptor gamma chain V region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-V1P06325 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcrg-V1P06325 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms