Protein–RNA interactions for Protein: P03980

Ig heavy chain V region TEPC 1017, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P03980 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P03980 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P03980 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P03980 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P03980 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P03980 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P03980 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P03980 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03980 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03980 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03980 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03980 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03980 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03980 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03980 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03980 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03980 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03980 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03980 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03980 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03980 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03980 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03980 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03980 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03980 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03980 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03980 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03980 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03980 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03980 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03980 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P03980 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P03980 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P03980 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P03980 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P03980 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P03980 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P03980 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P03980 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P03980 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P03980 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P03980 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P03980 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P03980 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P03980 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P03980 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P03980 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P03980 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P03980 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P03980 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P03980 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P03980 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P03980 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P03980 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P03980 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P03980 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P03980 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P03980 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P03980 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P03980 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P03980 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P03980 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P03980 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P03980 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P03980 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P03980 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P03980 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P03980 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P03980 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P03980 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P03980 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P03980 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P03980 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P03980 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P03980 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P03980 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P03980 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P03980 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P03980 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P03980 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P03980 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P03980 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P03980 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P03980 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P03980 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P03980 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P03980 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P03980 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P03980 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P03980 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P03980 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P03980 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P03980 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P03980 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P03980 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P03980 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P03980 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P03980 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P03980 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P03980 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms