Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01647 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01647 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01647 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01647 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01647 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01647 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01647 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01647 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01647 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01647 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01647 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
P01647 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01647 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01647 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01647 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01647 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01647 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01647 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01647 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01647 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01647 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01647 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01647 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01647 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01647 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
P01647 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01647 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01647 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01647 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01647 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01647 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01647 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01647 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01647 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01647 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01647 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01647 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01647 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01647 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01647 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01647 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01647 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01647 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01647 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01647 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01647 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01647 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01647 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01647 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01647 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01647 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
P01647 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01647 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01647 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01647 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01647 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01647 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01647 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01647 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01647 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01647 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01647 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01647 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01647 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
P01647 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01647 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01647 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01647 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01647 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01647 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01647 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01647 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01647 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01647 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
P01647 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01647 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01647 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P01647 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P01647 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01647 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01647 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
P01647 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
P01647 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01647 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01647 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01647 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01647 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01647 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.31■■□□□ 1
P01647 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.31■■□□□ 1
P01647 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
P01647 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
P01647 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01647 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
P01647 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
P01647 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01647 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01647 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01647 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01647 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms