Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Zc3h12bG3X9I7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zc3h12bG3X9I7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms