Protein–RNA interactions for Protein: F6ZNL5

Pcdh11x, Protocadherin 11 X-linked, mousemouse

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh11xF6ZNL5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdh11xF6ZNL5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdh11xF6ZNL5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdh11xF6ZNL5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdh11xF6ZNL5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdh11xF6ZNL5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdh11xF6ZNL5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdh11xF6ZNL5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdh11xF6ZNL5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdh11xF6ZNL5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdh11xF6ZNL5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdh11xF6ZNL5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdh11xF6ZNL5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdh11xF6ZNL5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdh11xF6ZNL5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms