Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Trappc8E9PWG2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Trappc8E9PWG2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Trappc8E9PWG2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trappc8E9PWG2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trappc8E9PWG2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trappc8E9PWG2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trappc8E9PWG2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trappc8E9PWG2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trappc8E9PWG2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trappc8E9PWG2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trappc8E9PWG2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Trappc8E9PWG2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trappc8E9PWG2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trappc8E9PWG2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trappc8E9PWG2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trappc8E9PWG2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trappc8E9PWG2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trappc8E9PWG2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trappc8E9PWG2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trappc8E9PWG2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trappc8E9PWG2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Trappc8E9PWG2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trappc8E9PWG2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trappc8E9PWG2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Trappc8E9PWG2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms