Protein–RNA interactions for Protein: A2AEN9

Gm5938, Predicted gene 5938, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5938A2AEN9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Gm5938A2AEN9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm5938A2AEN9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm5938A2AEN9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Gm5938A2AEN9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm5938A2AEN9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm5938A2AEN9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm5938A2AEN9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Gm5938A2AEN9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm5938A2AEN9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Gm5938A2AEN9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Gm5938A2AEN9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Gm5938A2AEN9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm5938A2AEN9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm5938A2AEN9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm5938A2AEN9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Gm5938A2AEN9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Gm5938A2AEN9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Gm5938A2AEN9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Gm5938A2AEN9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm5938A2AEN9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Gm5938A2AEN9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Gm5938A2AEN9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm5938A2AEN9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm5938A2AEN9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm5938A2AEN9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm5938A2AEN9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm5938A2AEN9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm5938A2AEN9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm5938A2AEN9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm5938A2AEN9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm5938A2AEN9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm5938A2AEN9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm5938A2AEN9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm5938A2AEN9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm5938A2AEN9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm5938A2AEN9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm5938A2AEN9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm5938A2AEN9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm5938A2AEN9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm5938A2AEN9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm5938A2AEN9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms