Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdc27A2A6Q5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms