Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80eA0A0U1RP99 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms