Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AatfQ9JKX4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AatfQ9JKX4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
AatfQ9JKX4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AatfQ9JKX4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AatfQ9JKX4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.8 ms