Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmx1aQ9JKU8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms