Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms