Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms