Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smim23Q9DAL0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms