Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp2c55Q9D816 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp2c55Q9D816 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp2c55Q9D816 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp2c55Q9D816 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp2c55Q9D816 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp2c55Q9D816 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp2c55Q9D816 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp2c55Q9D816 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyp2c55Q9D816 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyp2c55Q9D816 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyp2c55Q9D816 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyp2c55Q9D816 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyp2c55Q9D816 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyp2c55Q9D816 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyp2c55Q9D816 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyp2c55Q9D816 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp2c55Q9D816 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.3 ms