Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpsap1Q9D0M1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 292.7 ms