Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc43Q9CR29 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms