Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cln3Q61124 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cln3Q61124 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cln3Q61124 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms