Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKS2

Smim7, Small integral membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim7Q5RKS2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Smim7Q5RKS2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms