Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa11P50709 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa11P50709 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa11P50709 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defa11P50709 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa11P50709 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa11P50709 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa11P50709 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa11P50709 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms