Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Defa2P28309 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Defa2P28309 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Defa2P28309 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Defa2P28309 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Defa2P28309 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Defa2P28309 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Defa2P28309 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Defa2P28309 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Defa2P28309 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Defa2P28309 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Defa2P28309 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Defa2P28309 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Defa2P28309 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Defa2P28309 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Defa2P28309 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Defa2P28309 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Defa2P28309 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Defa2P28309 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Defa2P28309 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Defa2P28309 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Defa2P28309 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Defa2P28309 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Defa2P28309 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Defa2P28309 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Defa2P28309 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Defa2P28309 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Defa2P28309 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms