Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Spi1P17433 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spi1P17433 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spi1P17433 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spi1P17433 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spi1P17433 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spi1P17433 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spi1P17433 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Spi1P17433 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spi1P17433 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms