Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgf4P11403 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms