Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rabep1O35551 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rabep1O35551 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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