Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pabpc4lG5E8X2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pabpc4lG5E8X2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms