Protein–RNA interactions for Protein: F6ZNL5

Pcdh11x, Protocadherin 11 X-linked, mousemouse

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh11xF6ZNL5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdh11xF6ZNL5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdh11xF6ZNL5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms