Protein–RNA interactions for Protein: A2AMD2

Ankrd60, Ankyrin repeat domain 60, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd60A2AMD2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd60A2AMD2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd60A2AMD2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ankrd60A2AMD2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ankrd60A2AMD2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd60A2AMD2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd60A2AMD2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd60A2AMD2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd60A2AMD2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd60A2AMD2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd60A2AMD2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd60A2AMD2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd60A2AMD2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd60A2AMD2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd60A2AMD2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd60A2AMD2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd60A2AMD2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd60A2AMD2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd60A2AMD2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd60A2AMD2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd60A2AMD2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd60A2AMD2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd60A2AMD2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd60A2AMD2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd60A2AMD2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd60A2AMD2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd60A2AMD2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd60A2AMD2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd60A2AMD2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms