Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80eA0A0U1RP99 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80eA0A0U1RP99 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ino80eA0A0U1RP99 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms