Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1S5

Sept3, Neuronal-specific septin-3, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept3Q9Z1S5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sept3Q9Z1S5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Sept3Q9Z1S5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sept3Q9Z1S5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sept3Q9Z1S5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sept3Q9Z1S5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sept3Q9Z1S5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Sept3Q9Z1S5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sept3Q9Z1S5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sept3Q9Z1S5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sept3Q9Z1S5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sept3Q9Z1S5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sept3Q9Z1S5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sept3Q9Z1S5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sept3Q9Z1S5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sept3Q9Z1S5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sept3Q9Z1S5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sept3Q9Z1S5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Sept3Q9Z1S5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sept3Q9Z1S5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sept3Q9Z1S5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sept3Q9Z1S5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sept3Q9Z1S5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sept3Q9Z1S5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sept3Q9Z1S5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sept3Q9Z1S5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sept3Q9Z1S5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sept3Q9Z1S5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sept3Q9Z1S5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sept3Q9Z1S5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sept3Q9Z1S5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sept3Q9Z1S5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sept3Q9Z1S5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sept3Q9Z1S5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sept3Q9Z1S5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sept3Q9Z1S5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sept3Q9Z1S5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sept3Q9Z1S5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sept3Q9Z1S5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sept3Q9Z1S5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sept3Q9Z1S5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sept3Q9Z1S5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sept3Q9Z1S5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sept3Q9Z1S5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sept3Q9Z1S5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sept3Q9Z1S5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sept3Q9Z1S5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sept3Q9Z1S5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sept3Q9Z1S5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sept3Q9Z1S5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sept3Q9Z1S5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sept3Q9Z1S5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Sept3Q9Z1S5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sept3Q9Z1S5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sept3Q9Z1S5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sept3Q9Z1S5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sept3Q9Z1S5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sept3Q9Z1S5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sept3Q9Z1S5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sept3Q9Z1S5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sept3Q9Z1S5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sept3Q9Z1S5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sept3Q9Z1S5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sept3Q9Z1S5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sept3Q9Z1S5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sept3Q9Z1S5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sept3Q9Z1S5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Sept3Q9Z1S5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sept3Q9Z1S5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sept3Q9Z1S5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sept3Q9Z1S5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sept3Q9Z1S5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sept3Q9Z1S5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sept3Q9Z1S5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sept3Q9Z1S5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sept3Q9Z1S5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sept3Q9Z1S5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sept3Q9Z1S5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sept3Q9Z1S5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sept3Q9Z1S5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sept3Q9Z1S5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sept3Q9Z1S5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Sept3Q9Z1S5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sept3Q9Z1S5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sept3Q9Z1S5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Sept3Q9Z1S5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sept3Q9Z1S5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sept3Q9Z1S5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sept3Q9Z1S5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sept3Q9Z1S5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sept3Q9Z1S5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sept3Q9Z1S5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Sept3Q9Z1S5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sept3Q9Z1S5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sept3Q9Z1S5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sept3Q9Z1S5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sept3Q9Z1S5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sept3Q9Z1S5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sept3Q9Z1S5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sept3Q9Z1S5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms