Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VarsQ9Z1Q9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VarsQ9Z1Q9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VarsQ9Z1Q9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VarsQ9Z1Q9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VarsQ9Z1Q9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VarsQ9Z1Q9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VarsQ9Z1Q9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VarsQ9Z1Q9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VarsQ9Z1Q9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VarsQ9Z1Q9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VarsQ9Z1Q9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VarsQ9Z1Q9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VarsQ9Z1Q9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VarsQ9Z1Q9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VarsQ9Z1Q9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VarsQ9Z1Q9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VarsQ9Z1Q9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VarsQ9Z1Q9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VarsQ9Z1Q9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VarsQ9Z1Q9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VarsQ9Z1Q9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VarsQ9Z1Q9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VarsQ9Z1Q9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VarsQ9Z1Q9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VarsQ9Z1Q9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VarsQ9Z1Q9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VarsQ9Z1Q9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VarsQ9Z1Q9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VarsQ9Z1Q9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VarsQ9Z1Q9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VarsQ9Z1Q9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VarsQ9Z1Q9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VarsQ9Z1Q9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VarsQ9Z1Q9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VarsQ9Z1Q9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VarsQ9Z1Q9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VarsQ9Z1Q9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VarsQ9Z1Q9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VarsQ9Z1Q9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VarsQ9Z1Q9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VarsQ9Z1Q9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VarsQ9Z1Q9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VarsQ9Z1Q9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VarsQ9Z1Q9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VarsQ9Z1Q9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VarsQ9Z1Q9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VarsQ9Z1Q9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VarsQ9Z1Q9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VarsQ9Z1Q9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VarsQ9Z1Q9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VarsQ9Z1Q9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VarsQ9Z1Q9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VarsQ9Z1Q9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VarsQ9Z1Q9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VarsQ9Z1Q9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VarsQ9Z1Q9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VarsQ9Z1Q9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VarsQ9Z1Q9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VarsQ9Z1Q9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VarsQ9Z1Q9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VarsQ9Z1Q9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VarsQ9Z1Q9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VarsQ9Z1Q9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VarsQ9Z1Q9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VarsQ9Z1Q9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VarsQ9Z1Q9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VarsQ9Z1Q9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VarsQ9Z1Q9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VarsQ9Z1Q9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VarsQ9Z1Q9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VarsQ9Z1Q9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VarsQ9Z1Q9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VarsQ9Z1Q9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VarsQ9Z1Q9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VarsQ9Z1Q9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VarsQ9Z1Q9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VarsQ9Z1Q9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VarsQ9Z1Q9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VarsQ9Z1Q9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VarsQ9Z1Q9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VarsQ9Z1Q9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VarsQ9Z1Q9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VarsQ9Z1Q9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VarsQ9Z1Q9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VarsQ9Z1Q9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VarsQ9Z1Q9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VarsQ9Z1Q9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VarsQ9Z1Q9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VarsQ9Z1Q9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VarsQ9Z1Q9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VarsQ9Z1Q9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VarsQ9Z1Q9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VarsQ9Z1Q9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VarsQ9Z1Q9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VarsQ9Z1Q9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VarsQ9Z1Q9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VarsQ9Z1Q9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VarsQ9Z1Q9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VarsQ9Z1Q9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms