Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfrp4Q9Z1N6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfrp4Q9Z1N6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfrp4Q9Z1N6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sfrp4Q9Z1N6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sfrp4Q9Z1N6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sfrp4Q9Z1N6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sfrp4Q9Z1N6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sfrp4Q9Z1N6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sfrp4Q9Z1N6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sfrp4Q9Z1N6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sfrp4Q9Z1N6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfrp4Q9Z1N6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sfrp4Q9Z1N6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sfrp4Q9Z1N6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sfrp4Q9Z1N6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sfrp4Q9Z1N6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfrp4Q9Z1N6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfrp4Q9Z1N6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sfrp4Q9Z1N6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sfrp4Q9Z1N6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sfrp4Q9Z1N6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sfrp4Q9Z1N6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sfrp4Q9Z1N6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sfrp4Q9Z1N6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sfrp4Q9Z1N6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sfrp4Q9Z1N6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sfrp4Q9Z1N6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sfrp4Q9Z1N6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Sfrp4Q9Z1N6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sfrp4Q9Z1N6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sfrp4Q9Z1N6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sfrp4Q9Z1N6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sfrp4Q9Z1N6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sfrp4Q9Z1N6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sfrp4Q9Z1N6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sfrp4Q9Z1N6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sfrp4Q9Z1N6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sfrp4Q9Z1N6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sfrp4Q9Z1N6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sfrp4Q9Z1N6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sfrp4Q9Z1N6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sfrp4Q9Z1N6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sfrp4Q9Z1N6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sfrp4Q9Z1N6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sfrp4Q9Z1N6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sfrp4Q9Z1N6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sfrp4Q9Z1N6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sfrp4Q9Z1N6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sfrp4Q9Z1N6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sfrp4Q9Z1N6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfrp4Q9Z1N6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sfrp4Q9Z1N6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sfrp4Q9Z1N6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sfrp4Q9Z1N6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sfrp4Q9Z1N6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sfrp4Q9Z1N6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sfrp4Q9Z1N6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfrp4Q9Z1N6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfrp4Q9Z1N6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfrp4Q9Z1N6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sfrp4Q9Z1N6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sfrp4Q9Z1N6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sfrp4Q9Z1N6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sfrp4Q9Z1N6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sfrp4Q9Z1N6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sfrp4Q9Z1N6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Sfrp4Q9Z1N6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfrp4Q9Z1N6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfrp4Q9Z1N6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfrp4Q9Z1N6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfrp4Q9Z1N6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfrp4Q9Z1N6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sfrp4Q9Z1N6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sfrp4Q9Z1N6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sfrp4Q9Z1N6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sfrp4Q9Z1N6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sfrp4Q9Z1N6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sfrp4Q9Z1N6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sfrp4Q9Z1N6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms