Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Xpr1Q9Z0U0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xpr1Q9Z0U0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xpr1Q9Z0U0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xpr1Q9Z0U0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Xpr1Q9Z0U0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Xpr1Q9Z0U0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xpr1Q9Z0U0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Xpr1Q9Z0U0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xpr1Q9Z0U0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Xpr1Q9Z0U0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Xpr1Q9Z0U0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Xpr1Q9Z0U0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Xpr1Q9Z0U0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Xpr1Q9Z0U0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Xpr1Q9Z0U0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Xpr1Q9Z0U0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Xpr1Q9Z0U0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Xpr1Q9Z0U0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Xpr1Q9Z0U0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Xpr1Q9Z0U0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Xpr1Q9Z0U0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Xpr1Q9Z0U0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Xpr1Q9Z0U0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xpr1Q9Z0U0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Xpr1Q9Z0U0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Xpr1Q9Z0U0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xpr1Q9Z0U0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Xpr1Q9Z0U0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xpr1Q9Z0U0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xpr1Q9Z0U0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xpr1Q9Z0U0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xpr1Q9Z0U0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xpr1Q9Z0U0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xpr1Q9Z0U0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xpr1Q9Z0U0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Xpr1Q9Z0U0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Xpr1Q9Z0U0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Xpr1Q9Z0U0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Xpr1Q9Z0U0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Xpr1Q9Z0U0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Xpr1Q9Z0U0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xpr1Q9Z0U0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Xpr1Q9Z0U0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xpr1Q9Z0U0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Xpr1Q9Z0U0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Xpr1Q9Z0U0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xpr1Q9Z0U0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xpr1Q9Z0U0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xpr1Q9Z0U0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xpr1Q9Z0U0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xpr1Q9Z0U0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xpr1Q9Z0U0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xpr1Q9Z0U0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xpr1Q9Z0U0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xpr1Q9Z0U0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xpr1Q9Z0U0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xpr1Q9Z0U0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xpr1Q9Z0U0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xpr1Q9Z0U0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xpr1Q9Z0U0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xpr1Q9Z0U0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xpr1Q9Z0U0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xpr1Q9Z0U0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Xpr1Q9Z0U0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Xpr1Q9Z0U0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Xpr1Q9Z0U0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xpr1Q9Z0U0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xpr1Q9Z0U0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xpr1Q9Z0U0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xpr1Q9Z0U0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xpr1Q9Z0U0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Xpr1Q9Z0U0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Xpr1Q9Z0U0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xpr1Q9Z0U0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xpr1Q9Z0U0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xpr1Q9Z0U0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xpr1Q9Z0U0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Xpr1Q9Z0U0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Xpr1Q9Z0U0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Xpr1Q9Z0U0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Xpr1Q9Z0U0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xpr1Q9Z0U0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xpr1Q9Z0U0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Xpr1Q9Z0U0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xpr1Q9Z0U0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Xpr1Q9Z0U0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Xpr1Q9Z0U0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Xpr1Q9Z0U0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Xpr1Q9Z0U0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Xpr1Q9Z0U0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Xpr1Q9Z0U0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Xpr1Q9Z0U0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Xpr1Q9Z0U0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Xpr1Q9Z0U0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Xpr1Q9Z0U0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Xpr1Q9Z0U0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Xpr1Q9Z0U0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xpr1Q9Z0U0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xpr1Q9Z0U0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms