Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M3

Cdh20, Cadherin-20, mousemouse

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh20Q9Z0M3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh20Q9Z0M3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh20Q9Z0M3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdh20Q9Z0M3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdh20Q9Z0M3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdh20Q9Z0M3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdh20Q9Z0M3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh20Q9Z0M3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdh20Q9Z0M3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdh20Q9Z0M3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh20Q9Z0M3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdh20Q9Z0M3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdh20Q9Z0M3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh20Q9Z0M3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh20Q9Z0M3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdh20Q9Z0M3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdh20Q9Z0M3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh20Q9Z0M3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh20Q9Z0M3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh20Q9Z0M3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh20Q9Z0M3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh20Q9Z0M3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh20Q9Z0M3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh20Q9Z0M3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdh20Q9Z0M3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh20Q9Z0M3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdh20Q9Z0M3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdh20Q9Z0M3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdh20Q9Z0M3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdh20Q9Z0M3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdh20Q9Z0M3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdh20Q9Z0M3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdh20Q9Z0M3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdh20Q9Z0M3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdh20Q9Z0M3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdh20Q9Z0M3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdh20Q9Z0M3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdh20Q9Z0M3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh20Q9Z0M3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh20Q9Z0M3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh20Q9Z0M3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh20Q9Z0M3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh20Q9Z0M3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh20Q9Z0M3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh20Q9Z0M3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh20Q9Z0M3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh20Q9Z0M3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh20Q9Z0M3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh20Q9Z0M3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh20Q9Z0M3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh20Q9Z0M3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh20Q9Z0M3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh20Q9Z0M3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh20Q9Z0M3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh20Q9Z0M3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh20Q9Z0M3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh20Q9Z0M3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh20Q9Z0M3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh20Q9Z0M3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh20Q9Z0M3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh20Q9Z0M3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh20Q9Z0M3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdh20Q9Z0M3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdh20Q9Z0M3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh20Q9Z0M3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh20Q9Z0M3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdh20Q9Z0M3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdh20Q9Z0M3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdh20Q9Z0M3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdh20Q9Z0M3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdh20Q9Z0M3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdh20Q9Z0M3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdh20Q9Z0M3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdh20Q9Z0M3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh20Q9Z0M3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh20Q9Z0M3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh20Q9Z0M3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh20Q9Z0M3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh20Q9Z0M3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh20Q9Z0M3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh20Q9Z0M3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh20Q9Z0M3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdh20Q9Z0M3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdh20Q9Z0M3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdh20Q9Z0M3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdh20Q9Z0M3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdh20Q9Z0M3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdh20Q9Z0M3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh20Q9Z0M3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh20Q9Z0M3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh20Q9Z0M3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh20Q9Z0M3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh20Q9Z0M3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh20Q9Z0M3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh20Q9Z0M3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh20Q9Z0M3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh20Q9Z0M3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh20Q9Z0M3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdh20Q9Z0M3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh20Q9Z0M3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms