Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AireQ9Z0E3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AireQ9Z0E3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AireQ9Z0E3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AireQ9Z0E3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AireQ9Z0E3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AireQ9Z0E3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AireQ9Z0E3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AireQ9Z0E3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AireQ9Z0E3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AireQ9Z0E3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AireQ9Z0E3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AireQ9Z0E3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AireQ9Z0E3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AireQ9Z0E3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AireQ9Z0E3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AireQ9Z0E3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AireQ9Z0E3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AireQ9Z0E3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AireQ9Z0E3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AireQ9Z0E3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AireQ9Z0E3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AireQ9Z0E3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AireQ9Z0E3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AireQ9Z0E3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AireQ9Z0E3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AireQ9Z0E3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AireQ9Z0E3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AireQ9Z0E3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AireQ9Z0E3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AireQ9Z0E3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AireQ9Z0E3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AireQ9Z0E3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AireQ9Z0E3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AireQ9Z0E3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AireQ9Z0E3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AireQ9Z0E3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AireQ9Z0E3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AireQ9Z0E3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AireQ9Z0E3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AireQ9Z0E3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AireQ9Z0E3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AireQ9Z0E3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AireQ9Z0E3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AireQ9Z0E3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AireQ9Z0E3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AireQ9Z0E3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AireQ9Z0E3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AireQ9Z0E3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AireQ9Z0E3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AireQ9Z0E3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AireQ9Z0E3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AireQ9Z0E3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AireQ9Z0E3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AireQ9Z0E3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AireQ9Z0E3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AireQ9Z0E3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AireQ9Z0E3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AireQ9Z0E3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AireQ9Z0E3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AireQ9Z0E3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AireQ9Z0E3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AireQ9Z0E3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AireQ9Z0E3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AireQ9Z0E3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AireQ9Z0E3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AireQ9Z0E3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AireQ9Z0E3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AireQ9Z0E3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AireQ9Z0E3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AireQ9Z0E3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AireQ9Z0E3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AireQ9Z0E3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AireQ9Z0E3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AireQ9Z0E3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AireQ9Z0E3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AireQ9Z0E3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AireQ9Z0E3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AireQ9Z0E3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AireQ9Z0E3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AireQ9Z0E3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AireQ9Z0E3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AireQ9Z0E3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
AireQ9Z0E3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AireQ9Z0E3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AireQ9Z0E3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AireQ9Z0E3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AireQ9Z0E3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AireQ9Z0E3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AireQ9Z0E3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AireQ9Z0E3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AireQ9Z0E3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AireQ9Z0E3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AireQ9Z0E3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AireQ9Z0E3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AireQ9Z0E3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AireQ9Z0E3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AireQ9Z0E3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AireQ9Z0E3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AireQ9Z0E3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms