Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PapolbQ9WVP6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PapolbQ9WVP6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PapolbQ9WVP6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PapolbQ9WVP6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PapolbQ9WVP6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PapolbQ9WVP6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PapolbQ9WVP6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PapolbQ9WVP6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PapolbQ9WVP6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PapolbQ9WVP6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PapolbQ9WVP6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PapolbQ9WVP6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PapolbQ9WVP6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PapolbQ9WVP6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PapolbQ9WVP6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PapolbQ9WVP6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PapolbQ9WVP6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PapolbQ9WVP6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PapolbQ9WVP6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PapolbQ9WVP6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PapolbQ9WVP6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PapolbQ9WVP6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PapolbQ9WVP6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PapolbQ9WVP6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PapolbQ9WVP6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PapolbQ9WVP6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PapolbQ9WVP6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PapolbQ9WVP6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PapolbQ9WVP6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PapolbQ9WVP6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PapolbQ9WVP6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PapolbQ9WVP6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PapolbQ9WVP6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PapolbQ9WVP6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PapolbQ9WVP6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PapolbQ9WVP6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PapolbQ9WVP6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PapolbQ9WVP6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PapolbQ9WVP6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PapolbQ9WVP6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PapolbQ9WVP6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PapolbQ9WVP6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PapolbQ9WVP6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PapolbQ9WVP6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PapolbQ9WVP6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PapolbQ9WVP6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PapolbQ9WVP6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PapolbQ9WVP6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PapolbQ9WVP6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PapolbQ9WVP6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PapolbQ9WVP6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PapolbQ9WVP6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PapolbQ9WVP6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PapolbQ9WVP6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PapolbQ9WVP6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PapolbQ9WVP6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PapolbQ9WVP6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PapolbQ9WVP6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PapolbQ9WVP6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PapolbQ9WVP6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PapolbQ9WVP6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PapolbQ9WVP6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PapolbQ9WVP6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PapolbQ9WVP6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PapolbQ9WVP6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PapolbQ9WVP6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PapolbQ9WVP6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PapolbQ9WVP6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PapolbQ9WVP6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PapolbQ9WVP6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PapolbQ9WVP6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PapolbQ9WVP6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PapolbQ9WVP6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PapolbQ9WVP6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PapolbQ9WVP6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PapolbQ9WVP6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PapolbQ9WVP6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PapolbQ9WVP6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PapolbQ9WVP6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PapolbQ9WVP6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PapolbQ9WVP6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PapolbQ9WVP6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PapolbQ9WVP6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PapolbQ9WVP6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PapolbQ9WVP6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PapolbQ9WVP6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PapolbQ9WVP6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PapolbQ9WVP6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PapolbQ9WVP6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PapolbQ9WVP6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PapolbQ9WVP6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PapolbQ9WVP6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PapolbQ9WVP6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PapolbQ9WVP6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PapolbQ9WVP6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PapolbQ9WVP6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PapolbQ9WVP6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PapolbQ9WVP6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PapolbQ9WVP6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms